指標體系設計原則
預警涉及評價、預測等內容，指標體系設計時要考慮到總體數(shù)量的適當，以及能夠最有效地表達食品安全預警的特征性、規(guī)律性和目標性。理想的指標體系可以參照系統(tǒng)相對最小型原則和相對完整性原則進行設計。
1.相對最小型原則
相對最小型是指標的總數(shù)量合理化精簡到最少，形成一個最小集。可以通過主成分分析、權重排序等方式方法客觀地精簡掉那些權重微弱的指標、獨立性差的指標和主觀性較強的指標，使指標的數(shù)量在能夠完成預警系統(tǒng)功能和準確程度的基礎上，總數(shù)量最少。這樣的集合既有利于降低分析計算的工作量，有利于加快指標分析速度。
實際上，此指標是可以替代、 分解或者綜合的。如果污染推標可以分解為具體的污染種類，而且污染種類之間已經建立了相互的關聯(lián)關系，那么，選取污染指標要比直接選擇污染種類的數(shù)量少得多。有些指標本身是滯后反應的，如中毒死亡數(shù)據(jù)是食源性疾病發(fā)生之后才會出現(xiàn)的情況，如果以食源性疾病作為指標，中毒死亡率指標就可以不納人體系。只要不會影響研究目的和結果的準確性，指標的替代和篩出對建立整個指標體系是有利的。
需要注意的是，在測量指標對于某個食品安全預警問題的影響時，是否可以篩出有時是很難決定的，因此，指標體系的最小型是相對面言的。
2.相對完整性原則
在總量相對最小的同時，要求指標體系還必須滿足一定的完整性， 能夠全面表達所考察的食品安全預警問題，指標表達的信息沒有缺漏和遺失。對于靜態(tài)指標和動態(tài)指標、宏觀指標和微觀指標、警情指標和警兆指標等應綜合考慮，要配備合理、充分科學。
完整性也是相對而言的。由于食品安全預警系統(tǒng)的制度建設和機制運行害要不斷加以完善，監(jiān)測檢測的技術水平和預警信息、數(shù)據(jù)的積累都是動態(tài)發(fā)展的，因此，有些指標對預警的貢獻程度也會發(fā)生變化。需要適時調整。面且，絕對的完整既做不到，也沒有必要。如關于食物對食源性疾病的影響，一些影響機理本身尚不成熟，所以，完整性只能是相對的。應在已有的相關研究的基礎上，恰當?shù)乜紤]研究問題所涉及的范疇，科學選擇指標，以保障指標體系具有合理必要的完整性。
指標體系架構設計
構建系統(tǒng)架構時可以根據(jù)研究的需要設計為多級層次結構。系統(tǒng)層次結構表述了不同層次子系統(tǒng)之間的隸屬關系或相互作用的關系， 不同的層次存在著不同的運動形式，從而構成系統(tǒng)的整體運動特性。用層次之間的表征方法既方便同層次之間的研究和比較，也有利于層與層之間的研究，使得復雜系統(tǒng)的關系清晰簡捷，便于分析。
食品安全預警指標系統(tǒng)考慮為多層次多警情并列式的結構，系統(tǒng)構建為總體層、分類系統(tǒng)層、指標層和指數(shù)層4個等級。
(1)總體層表達的是國家或者地區(qū)(根據(jù)預警系統(tǒng)的預警范圍界定)食品安全的總體警情程度，簡稱總體警度，代表著這個時期食品安全的總體狀況和安全發(fā)展態(tài)勢，指標就是食品安全總體警度。
(2)分類系統(tǒng)層根據(jù)總體層的預警目標設計分類子系統(tǒng)，如有學者將食品安全問題分成數(shù)量安全.質量安全和可持續(xù)安全，對應的預警系統(tǒng)層就分為數(shù)量預警系統(tǒng)。質是預警系統(tǒng)和可持續(xù)安全預警系統(tǒng)。鑒于我國食品安全監(jiān)管的現(xiàn)狀，從食品安全監(jiān)管的大系統(tǒng)角度出發(fā)，盡址利用我國已經建設和正在建設的有關食品安全的數(shù)據(jù)庫, 以及相關的研究成果，分類系統(tǒng)層可以按部門并列平行設置分類子系統(tǒng)。由于分類系統(tǒng)層是對預警目標的分解，所以也可以根據(jù)食品安全問題的特點和預警的功能特性設計。
分類系統(tǒng)層的每個子系統(tǒng)具有獨立性質，代表著系統(tǒng)要描述的特定的狀態(tài)、過程和變化的警情或警兆。
(3)指標層由表征分類子系統(tǒng)的主要特征要素組成。特征要素也稱為指標，要求能夠充分說明系統(tǒng)、表征系統(tǒng)，并盡可能準確反映系統(tǒng)警情狀況。
(4)指數(shù)層是指具體的可以通過監(jiān)測、檢測而獲取到的數(shù)值、信息，指數(shù)層對應于指標層。按照邏輯預警的思想，指數(shù)層具有景氣警兆和動向警兆特性。
基于這樣的架構設想。
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